MacOSでソフトウェア・アップデートができない場合があります。この解決方法は再起動を含むものを１つだけチェックしてアップデートさせることで解決します。また個別にアップデートができない場合も１つずつチェックしていくと問題なくアップデート出来る場合があります。
再起動を求められるので再起動します。
再起動を含むアップデートがあるものは最初にそれだけをアップデートさせてしまえば良いわけですね。他の再起動不要なアップデートは全てチェックが入っていても問題ない場合がほとんどなので、気にする必要はほとんどなくアップデートできます。再起動アップデートが複数ある場合も１つずつやると確実です。
また、これはMacOX10.7 Lionの話になります。OS10.8だとAppsでのアップデートになるので仕様は異なります。